تسلّمت الرّهبانيّة الدّير سنة 1708 من المطران يوحنا حبقوق، في عهد المؤسس الأب العام عبدالله قرألي، واتخذته الرّهبانيّة مركزاً للرئاسة العامّة من سنة 1708 حتى سنة 1723. تجدر الاشارة الى أن المؤرخين يرجحون تأسيسه الى أوائل القرن الرابع
وقد كان الدّير منذ القدم ركيزة الحياة النّسكيّة في الكنيسة المارونيّة وفيه أدخلت أوّل مطبعة وصلت الى الشرق. ويضمّ هذا الدّير مكتبة تحتوي على أرشيف ومخطوطات سريانيّة وموسوعات علميّة
سنة 1926 هدم الدّير القديم وأنشئ الجديد الذي انتهى العمل فيه سنة 1928
وفي سنة 1993، بدأت ورشة اعمار وتجديد كامل للدّير، تناولت اصلاحات داخليّة وخارجيّة
لدير مار أنطونيوس محبسة مار بولا يسكن فيها حاليّاً الأب الحبيس أنطوان رزق ومحبسة سيّدة حوقا يسكن فيها الأب الحبيس داريو اسكوبار
يحتفل الدّير بعيد مار أنطونيوس الكبير في 17 كانون الثاني